פצעים יכולים להופיע עקב טראומה גירויי שנגרם משיניים או מחומרים כלשהם, וירוסים וזיהומים או אפילו סימנים ראשונים של נגעים שאינם שפירים.
פצע בחלל הפה לרוב נרפא מעצמו תוך 7-10 ימים.
אם אין שיפור לאחר תקופה זו יש לפנות למרפאה.
פצעים כמו אפטה למשל יכולים להיות מטופלים בתכשיר שנקרא אפטגון או משחה כמו אורקורט אי.
אך טיפול זו הינו סימפטומטי בלבד ואינו מרפא אלא מקל על הסימפטומים באופן זמני.